1、防潮 如果室内潮湿，光学镜片容易生霉，生雾。一旦生霉，很难除去。内部的镜 片由于不便擦拭，潮湿对其危害性更大。机械零件受潮，容易生锈。为了防潮，除了选择干燥的房间外，存放地点也应离墙、离地、远离潮湿。显微镜箱内应放置1-2袋硅胶作干燥剂。
2、防尘 光学元件表面落入灰尘，不仅影响光线通过，而且经光学系统放大后，会生成很大的污斑，影响观察。灰尘、砂粒落入机械部分，还会增加磨损，引起运动受阻，危害同样很大。因此，经常保持显微镜的清洁。
3、防腐蚀 显微镜不能和具有腐蚀性的化学试剂放�一起，如硫酸、盐酸、强碱等。
4、防热 防热的目的主要是为了避免热胀冷缩引起的开胶与脱落。

使用时一定要正确操作，小心谨慎。在不少情况下，仪器的损坏是由于操作粗心或操作方法错误引起的。例如：

1、微调是显微镜机械装置中较精细而又容易损坏的元件，拧到了限位以后，就拧不动了。此时决不能强拧。否则，必然损坏。调焦时，遇到这样情况，应将微调退回3~5圈，重用粗调调焦，待初见物像后，在改用微调。如能事先将微调调至中间位置(一般在微动燕尾的侧面上刻有位.标记"- ="当微动燕尾上的单线对着两横线的中间时，微调即处于中间位置)，使正反两个方向都有大体相等的调节余量，当然更好。
2、使用高倍镜观察液体标本时，一定要加盖玻片。否则，不仅清晰度下降，而且试液容易浸入高倍镜的镜头内，使镜片遭受污染和腐蚀.
3、油镜使用后，一定要擦拭干净。香柏油在空气中暴露时间过长，就会变稠和干涸，到这时再去擦拭就比较困难了。镜片上留有油渍，清晰度必然下降。
4、仪器出了故障，不要勉强使用。否则，可能引起更大的故障和不良后果。例如，在粗动手轮不灵活时，如果强行.动，会使齿轮、赤条变形或损坏。
平时对显微镜的各光学部分的表面，用干净的毛笔清扫或用擦镜纸擦拭干净即行。在镜片上有摸不掉的污物、油渍或手印；镜片生霉、生雾；长期挺用后复用时，需要进行比较认真的擦拭。

擦拭范围 目镜和聚光镜允许拆开。物镜因结构复杂，装配时又要专门的仪器来校正才能恢复原有的精度，故严禁拆开。 拆卸目镜和聚光镜时，要注意以下几点：

(1)、 拆卸时要标记各元件的相对位置(可在外壳上划线作标记)、相对顺序和镜片的正反面，以防重装时弄错。
(2) 、操作环境保持清洁、干燥。拆卸目镜时，只要从两端旋出上下两块透镜即可。目镜内的视场光栏不能移动，否则会使视场界线模糊，聚光镜旋开后严禁进 镜，因其上透镜是油浸的，出厂时经过良好的密封，在分解会破坏它的密封性 2.擦拭方法 先用干净的毛笔或吹风球除去镜片表面的灰尘。然后用干净的绒布在 镜片中心开始向边缘作螺旋形单向运动。擦完一次把绒布换个地方，直至擦干净为止。如果镜片上有油渍、污物或指印等擦不掉时，可用柳枝条裹上脱脂棉，蘸少量酒精和乙醚 合液(酒精80%，乙醚20%)擦拭。如果有较重的霉点或霉斑无法除去。可用棉签 湿后粘上碳酸钙粉(含量为99%以上)进行擦拭。擦拭后，应将粉末清除干净。镜片是否干净可用可用镜片上的反射光线进行检查。要注意的是，擦拭前一定要将灰尘除净，否则灰尘中的砂粒会将镜面划起沟纹。不准用毛巾、手帕、衣服等去擦拭。酒精乙醚混合不可用的太多，以免脱胶。镜片表面有一层紫蓝色的透光膜，不要误作污物来擦拭。
(3) 表面涂漆部分，可用布擦拭。但不能使用酒精、乙醚等有机溶剂，以免脱漆