1 高质量RNA精准分选如何实现?|百贺仪器
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高质量RNA精准分选如何实现?

您是否遇到这些难题?

固定组织(PFA)无法提取高质量RNA

样本异质性强,结果不准确、不可靠

单细胞/空间转录组成本高、分辨率受限

珍贵病理样本有限,不足够开展多个实验

 

例如在肝脏等复杂组织研究中提取RNA分析面临以下挑战:

  • 组织异质性严重:肝脏包含肝细胞、胆管上皮、免疫细胞等,传统整体提取难以反映真实表达差异

  • 空间信息丢失:单细胞测序需组织解离,破坏细胞原位信息

  • 技术方案受限:空间转录组:图像分辨率或通量受限;传统 LCM(Laser Capture Microdissection,激光捕获显微切割)大多使用新鲜样本,无法利用大量病理固定组织

  • 病理固定组织RNA难以提取,降解快,缺乏标准化流程

  • 临床样本珍贵:无法转化为高质量和足够的RNA分析数据。

 

激光显微切割,即LMD(Laser Microdissection)技术,精准从组织切片中分离目标单细胞 / 特定组织区域,适配后续核酸提取测序。南方医科大学汪艳教授团队发表于Journal of Visualized Experiments的工作中第一作者曾伟兰博士作为方法学核心执行人,依托学校科研支持中心(中心实验室)平台及该平台配备的徕卡LMD激光显微切割系统,成功构建了一套从固定组织到RNA测序的标准化解决方案,实现精准到单细胞级别分选,兼容PFA固定+冰冻切片样本,5天内完成从取材到测序建库,1000个细胞即可获得高质量RNA分析结果的实践方案。该方案提供了一套完整可重复的标准化实验流程:样本制备 → LMD 精准切割 → RNA提取 → qPCR / RNA-seq。

真正实现:固定组织 → 精准分选 → 高通量分子分析

关键技术突破

01 固定组织RNA提取优化

  • 控制PFA固定时间24h,避免蛋白-核酸过度交联不可逆损伤RNA

  • 优化解交联 + 蛋白酶K消化体系,提高RNA释放效率

  • RNase全流程控制,保障RNA稳定性

02 高效LMD取样策略

  • 快速苏木素染色替代复杂免疫染色

  • 单张切片30–60min内完成切割,全部切割4h内结束,高效完成目标采集

  • 精准圈选目标细胞群,避免污染

03 微量样本高质量输出

  • 1000 cells → \~110 ng RNA

  • A260/A280:1.9–2.1

  • 文库片段:300–500 bp(符合测序要求)

该方案从临床到科研全面释放样本价值:

  • 肝病机制研究(MASH、肝损伤、纤维化等)

  • 特定细胞群表达谱分析

  • 微环境与免疫细胞研究

  • 固定病理样本回顾性研究

为什么选择徕卡LMD激光显微切割系统

高精度激光切割,细胞级分辨率

参数可控,适配不同组织类型

可在空间背景下通过可视化控制,实现纯净、无接触、无污染的样本采集

具备高通量处理能力,适应下游质谱等分析需求

样本采集使用标准耗材,通用方便

LMD激光显微切割系统不仅是一台激光显微切割显微镜,更是一套完整DVP解决方案,将细胞显微结构与分子连接,打开病理样本高价值再利用的可能。

 

 

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